Zimmermann, Jan

Sequenzadressiertes Self-Assembly eines DNA-Dodekaeders aus einem Satz von 20 Trisoligonucleotiden mit C_3h-symmetrischen Linkerelementen

Trisoligonucleotide mit C_3h-symmetrischen Linkern wurden am DNA-Synthesizer mittels eines orthogonal-geschützten, vom 1,3,5-Tris(hydroxypropyl)benzol abgeleiteten Phosphoramidits hergestellt. Durch Self-Assembly eines Satzes von 20 Trisoligonucleotiden mit entsprechendem Sequenzdesign wurde ein DNA-Nanoobjekt mit der Konnektivität eines Dodekaeders erzeugt. Das DNA-Objekt zeigte in gelelektrophoretischen Untersuchungen eine diskrete Bande. Es besteht zu gleichen Teilen aus den 20 Trisoligonucleotiden (³²P-Markierungen) und enthält keine einzelsträngige DNA (Mungbohnen-Nuclease Verdau). Kryo-elektronenmikroskopische und rasterkraftmikroskopische Untersuchungen weisen auf ein flexibles Objekt von 18 nm Größe hin. Die adressierbare Funktionalisierung der Nanostruktur konnte durch Einführung von Trisoligonucleotiden mit Überhangsequenzen erreicht werden, was durch Hybridisierung von RUBiGOLD- und Fluorescein-markierten Oligonucleotiden an das DNA-Dodekaeder demonstriert werden konnte.