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Oligonucleotidyle (ON) sind über e. Linker miteinander verknüpfte ON. Symmetrische ON werden durch Linker mit identischen Schutzgruppen synthetisiert, unsymmetrische durch Linker mit zwei orthogonalen. 3'-ON stellte man über
automatisierte Synthese an der Festphase, 5'-Derivate über e. templatgesteuerte Tris-Linking-Reaktion in Lösung an e. tridentalen Linkermolekül dar. Es wurden ON mit e. Stranglänge von 15 bzw. 21 Basen synthetisiert, über
präparative PAGE gereinigt und mittels HPLC und MALDI-TOF charakterisiert.
Zum Aufbau von DNA-Nanostrukturen (NS), wie die hier dargestellten Bi-/ Pyramiden, werden ON mit gleichen und unterschiedlichen Armen, in 3'- oder 5'-Ausrichtung, mit 3 und 4 Armen benötigt. Die Ausbildung der über Watson-Crick- und
Hoogsteen-Wechselwirkungen gebildeten pyramidalen NS beruhte auf sequenzadressiertem self-assembly der DNA-Bausteine. Die NS wurden durch PAGE, Verdau mit Nucleasen, FRET-Messungen und TEM-Spektoskopie-Messungen bewiesen.
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