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In dieser Arbeit wurde die Interaktion einer sn RNA mit dem p20.1-Protein untersucht. Es wurde der direkte Nachweis erbracht, dass die Wechselwirkung in intakten Zellen vorliegt. Auf Seite des Proteins wurde die RNA-Bindungsdomäne durch gezielte
Mutationen eingegrenzt. Durch 2D-NMR-Analysen konnte auf Seite der sn RNA dann eine berechnete Sekundärstruktur der an der Wechselwirkung beteiligten Subdomäne verifiziert werden. Das RNA-Aptamer wurde im Kontext einer höchst aktiv
transkribierten, viralen RNA in intakten Zellen überexprimiert. Anschließend wurden Transkriptomanalysen mit Microarray-Chips durchgeführt, in welchen signifikante Unterschiede im Vergleich zu Kontrollzellen beobachtet werden konnten, die
mit den Effekten bei einem siRNA-induzierten Knockdown des Proteins übereinstimmten. Diese Ergebnisse legen eine Regualtion der p20.1-kontrollierten zellulären Prozesse durch die sn RNA nahe.
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